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L’UMRS Paris Diderot-Inserm 973 dirigée par le Dr. BO Villoutreix (DR Inserm) est composée des 3 équipes localisées sur PRG (UFR Sciences du Vivant). L’unité travaille sur le développement de nouvelles approches in silico aidant la conception rationnelle de nouvelles molécules thérapeutiques et de sondes pharmacologiques.
La bioinformatique structurale et la chemoinformatique sont des disciplines de recherche bien établies avec de nombreuses applications dans le domaine des sciences du Vivant et de la Santé comme souligné par l’attribution du prix Nobel 2013 de chimie à trois scientifiques leaders des domaines. (voir d’autres commentaires sur le «In silico Drug Design»)
Notre objectif principal est de développer de nouveaux protocoles in silico et nouveaux algorithmes qui aident la conception de peptides et petites molécules chimiques «drug-like» de «haute qualité» avec des applications sur des protéines cibles, essentiellement dans les domaines des cancers, des maladies rares et des maladies cardiovasculaires.
Les mots «haute qualité» signifient que des efforts importants en termes de profilage de composés («pharmacologie des systèmes») et des prédictions ADME-Tox pour rejeter rapidement les molécules potentiellement nuisibles dès le début du processus de découverte de médicaments sont considérés.
De plus, nous travaillons activement sur des outils facilitant l’optimisation des molécules. La stratégie pour atteindre notre principal objectif compte tenu de nos compétences, le contexte national et international, et les suggestions d’un conseil consultatif externe est de concentrer nos efforts sur 3 axes de recherche complémentaires.
Pour augmenter nos chances de succès, nous avons réorganisé notre unité en 3 équipes, chacune se concentrant sur un axe de recherche. Les 3 équipes sont centrées sur le :
- Equipe 1 : "Structure-based peptide design" (Responsable: Dr P. Tufféry / Inserm)
- Equipe 2 : "Computational approaches applied to pharmacological profiling" (Responsables: Prs. A-C. Camproux & O. Taboureau / Université Paris Diderot)
- Equipe 3 : "Virtual screening and rational design of protein-protein interaction modulators with balanced ADME-Tox properties" (Responsable: Dr M. Miteva / Inserm)
Notre unité de recherche est fortement impliquée dans 2 plates-formes nationales IBISA :
- RPBS: une plateforme de bioinformatique structurale
- CDithem: un consortium pour la découverte de médicaments.
Nos travaux sont soutenus par : ANR, AnrS, INSERM, Paris-Diderot et INCa.
